Não, é impossível para uma faca corta um átomo.

Abaixo, temos uma imagem da lâmina de uma faca sob a visão de um microscópio eletrônico, em uma escala de 10.000:

Como pode ver, na visão normal, uma lâmina de uma faca parece ser afiada, porém, em uma escala de átomos, a lâmina não se torna tão afiada assim, sendo impossível ela cortar o átomo com esse tipo estrutura.

Então o que acontece quando cortamos algo com uma faca ?

Primeiramente, você deve entender que as ligações que unem os átomos em moléculas são fortes, mas as ligações que unem moléculas são fracas. Quando você corta algum material com a faca, você está apenas separando a ligação entre as moléculas e deformando elas. Em outras palavras, você está apenas destruindo a ligação delas com a pressão do seu braço, e a estrutura da faca, que possui moléculas mais fortes que a do material que você corta.

Fonte: https://pt.quora.com/Quando-se-usa-uma-faca-muito-afiada-para-cortar-um-objeto-se-corta-os-%C3%A1tomos-ou-eles-apenas-s%C3%A3o-empurrados-para-o-lado